PCR技術的問世使病原體檢測能夠快速、方便地進行。由于PCR技術假陽性率太高，只要有微量病原體存在就可得到陽性結果，這并不能作為診斷依據，只有當一定數量的病原體存在時才有臨床意義。因此，對模板準確定量顯得特別重要，應用熒光技術PCR就能夠快速、準確地得到結果。對于解決學檢測的“窗口期”問題，判斷疾病是否處于隱性或亞臨床狀態，以及檢測不能判定是現癥還是既往時，均可利用PCR進行確定。
示例：新型冠狀病毒核酸檢測。
方法學：熒光PCR法。
用途：用于體外定性檢測新型冠狀病毒的疑似病例、疑似聚集例患者、其他需要進行新型冠狀病毒診斷或鑒別。
檢測基因：新型冠狀病毒（2019-nCoV）ORFlab和N基因、E基因。
標本類型：上呼吸道標本：咽拭子、鼻拭子；下呼吸道標本：呼吸道抽取物、肺泡灌洗液樣本、肺組織活檢標本。
檢測流程：
（1）核酸檢測前的生物安全防護（工作人員個人三級防護的穿戴）→（2）樣本的滅活（56℃滅活30分鐘）→（3）樣本的核酸提取（手工、核酸提取儀）→（4）PCR體系的配制和模板加樣→（5）上機檢測及結果分析→（6）檢測后的消毒。
其他病原體檢測：HIV、甲乙丙肝、HPV、肺支、肺衣、EB病毒、腺病毒、胞病毒、甲乙流、埃博拉病毒、B族鏈球菌。
適合開展的醫院和：兒童醫院、婦幼、兒檢所、第三方、各種級別的有需求的醫院。
輔料的質檢通常是在新一批的輔料到實驗室后統一做一次或者定期（半年或1年）做，因此質檢就包含了驗貨和質檢2個部分。由于輔料的質檢沒有一個統一的標準，一般由各實驗室自行制定，可簡可繁，這里提出一些方法供大家參考和批評指正。
1.外包裝檢查：外包裝應完整無損無污，標識清楚，檢查品名、品牌，貨號，規格、生產日期，有效期、保存條件等信息。
2.內包裝檢查：內包裝物品應與外包裝標識一致，檢查是否有破損，泄漏，內容物是否齊全，是否有相應的使用說明書等。
3.性能質檢：檢測試劑耗材是否與其性能一致，比如吸頭的準確性和氣密性等
4.污染物質檢：檢測試劑耗材是否被常規檢測項目的待檢物污染，這種污染可能是物品生產環節，也可能是運輸或實驗室的保存過程中被污染。
5.抑制物質檢：檢測試劑耗材中是否存在PCR反應的抑制物，比如核酸酶。
1.實驗室空調通風系統設計及壓力控制
PCR實驗室并沒有嚴格的凈化要求，但是為避免各個實驗區域間交叉污染的可能性，宜采用全送全排的氣流組織形式。同時，要嚴格控制送、排風的比例以保證各實驗區的壓力要求。
2.污染的預防與控制
PCR實驗室設計的問題是如何避免污染。在實際工作中，常見的有以下幾種污染類型：擴增產物的污染；天然基因組DNA的污染；試劑的污染以及標本間的污染。由于一旦發生污染，實驗就必須停止，直到找到污染源為止，而且實驗結果必須作廢，需重新進行實驗。所以發生污染后再圍繞實驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣，浪費人力物力。因此要避免污染，首先應是預防，而不是排除。
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